研究表明，飼料發酵技術能有效降解飼料中的抗營養因子，促進養分的消化吸收，改善動物健康，減少飼用抗生素(促生長)的使用。選取合適的微生物進行飼料的發酵能有效降解飼料中的抗營養因子，促進養分的消化吸收，分泌的代謝產物如小肽，有機酸等利于改善動物健康。

近年來，隨著飼用抗生素使用的逐步受限，無抗養殖勢在必行，如何保障畜禽健康減少藥物依賴成為我國畜牧業的一大挑戰。常規的飼料原料中，玉米和豆粕是養殖中最常用的原料，而豆粕中的抗原蛋白、胰蛋白酶抑制劑及植酸等抗營養因子會阻礙消化道吸收利用營養物質，不利于動物生長和健康。

目前乳酸菌、酵母菌、枯草芽孢桿菌被廣泛引用于飼料發酵。其中，乳酸菌產生的有機酸、細菌素等代謝產物有利于改善飼料的營養品質，酵母菌能降解豆粕中的水蘇糖、棉子糖，而枯草芽孢桿菌對豆粕中抗原蛋白具有較強的降解效果。多菌株混合發酵理論上可以發揮不同菌株的發酵特性，但是不同菌株間存在可能存在拮抗作用，比如，當米曲霉和干酪乳桿菌直接混合發酵豆粕，會降低米曲霉對豆粕中抗原蛋白的降解效果。而采用菌酶協同發酵，可以提高發酵過程中微生物對飼料中大分子物質利用效率，如纖維素酶水解秸桿生成的單糖能為酵母菌合成菌體蛋白提供能量，進而提高飼料品質。

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